proteinanalyse

Что было

Первоначальная задача - создать простой одностраничный анализатор последовательностей.

Решение

Создан index.html с базовым функционалом:

• Автоопределение типа последовательности (DNA/Protein)
• Базовый анализ для обоих типов
• Минималистичный дизайн

Плюсы

• Быстрая реализация
• Простота использования
• Один файл - легко деплоить

Минусы

• Ограниченные SEO возможности (только одна страница)
• Нет специализированных инструментов
• Сложно ранжироваться по разным ключевым словам

Подводные камни

• Одна страница = один набор ключевых слов
• Сложно конкурировать с более специализированными инструментами

Что сделано

• Создан index.html с базовым функционалом
• Реализовано автоопределение типа последовательности
• Добавлен базовый анализ для DNA и Protein последовательностей

Что было

Осознание, что для SEO нужны отдельные страницы под разные ключевые слова.

Решение

Разбить функционал на 6 специализированных страниц:

• /index.html - главная страница (общий анализатор)
• /dna-gc-calculator.html - GC калькулятор
• /reverse-complement.html - обратная комплементарная последовательность
• /orf-finder.html - поиск ORF
• /protein-mw-calculator.html - молекулярная масса белка
• /sequence-translation.html - трансляция ДНК

Почему такое решение

• Каждая страница оптимизирована под конкретные ключевые слова
• Пользователи ищут конкретные инструменты ("GC calculator", "ORF finder")
• Больше страниц = больше возможностей для ранжирования
• Внутренние ссылки улучшают SEO

Плюсы

• ✅ Лучшее SEO покрытие (6 страниц вместо 1)
• ✅ Специализация под конкретные запросы
• ✅ Внутренняя перелинковка
• ✅ Пользователи находят именно то, что ищут

Минусы

• ❌ Больше файлов для поддержки
• ❌ Дублирование кода (если не использовать общие компоненты)

Подводные камни

• Нужно было решить проблему дублирования кода
• Важно было сохранить единообразие дизайна

Что сделано

• Создано 6 специализированных страниц
• Настроена навигация между страницами

Что было

Код дублировался между страницами (функции для GC%, reverse complement, translation и т.д.)

Решение

Создан common.js с общими функциями:

• cleanSequence() - очистка последовательности
• computeGC() - расчет GC%
• reverseComplement() - обратная комплементарная последовательность
• translateDNA() - трансляция ДНК
• findORF() - поиск ORF
• computeMW() - молекулярная масса
• И другие...

Почему такое решение

• DRY принцип (Don't Repeat Yourself)
• Легче поддерживать - изменения в одном месте
• Меньше размер кода
• Единообразие результатов

Плюсы

• ✅ Нет дублирования кода
• ✅ Легкая поддержка
• ✅ Единообразие функций
• ✅ Можно переиспользовать в будущем

Минусы

• ❌ Все страницы зависят от одного файла
• ❌ Нужно загружать common.js даже если используется одна функция

Подводные камни

• Важно было не перегрузить common.js лишним кодом
• Нужно было сохранить совместимость между страницами

Что сделано

• Создан common.js с общими функциями
• Все страницы используют общую библиотеку
• Устранено дублирование кода между страницами

Что было

Каждая страница могла иметь свой стиль, не было навигации между страницами.

Решение

• Создан единый styles.css для всех страниц
• Добавлена функция getNavigation() в common.js
• Навигационное меню на каждой странице

Почему такое решение

• Единообразный дизайн = профессиональный вид
• Навигация улучшает UX и SEO (внутренние ссылки)
• Пользователи могут легко переключаться между инструментами

Плюсы

• ✅ Профессиональный внешний вид
• ✅ Улучшенная навигация
• ✅ Внутренние ссылки для SEO
• ✅ Лучший UX

Минусы

• ❌ Если нужно изменить дизайн - меняем везде
• ❌ Навигация добавляет немного HTML на каждую страницу

Подводные камни

• Нужно было сделать навигацию адаптивной для мобильных
• Важно было не перегрузить страницы лишними элементами

Что сделано

• Создан единый styles.css для всех страниц
• Добавлена функция getNavigation() в common.js
• Навигационное меню на каждой странице

Что было

Страницы были функциональными, но не оптимизированы для поисковых систем.

Решение

Для каждой страницы добавлено:

• Уникальный <title> с ключевыми словами
• <h1> с основным ключевым словом
• Meta description и keywords
• 150-200 слов SEO текста с синонимами и внутренними ссылками
• Schema markup (JSON-LD)

Почему такое решение

• Каждая страница должна ранжироваться по своим ключевым словам
• SEO текст показывает релевантность страницы
• Внутренние ссылки распределяют "вес" между страницами
• Schema markup помогает поисковикам понять структуру

Плюсы

• ✅ Лучшее ранжирование в поисковиках
• ✅ Каждая страница оптимизирована под свои запросы
• ✅ Больше возможностей для органического трафика
• ✅ Профессиональный подход к SEO

Минусы

• ❌ Больше текста на странице (но это хорошо для SEO)
• ❌ Нужно поддерживать актуальность SEO текстов

Подводные камни

• Важно было не переоптимизировать (keyword stuffing)
• SEO текст должен быть естественным и полезным
• Нужно было балансировать между SEO и UX

Что сделано

• Добавлены уникальные <title> и <h1> для каждой страницы
• Добавлены meta description и keywords
• Добавлено 150-200 слов SEO текста на каждой странице
• Добавлен Schema markup (JSON-LD) для лучшего понимания структуры поисковиками

Что было

Пользователям нужно было вводить последовательности вручную, чтобы понять, как работает инструмент.

Решение

На каждой странице добавлена кнопка "Load Example" с предустановленными примерами:

• Sequence Analyzer (index.html):
• DNA пример: ATGCGTACCTGACTGGAAGGCTTACGATGCTTGAAGACCTGA
• Protein пример: MKTFFVAGLVLAGALAAPALA
• GC Calculator: GCGGATCCGTCGATGCGGCCGTTAGCGCGATCATGGCCGCA
• Reverse Complement: ATGACCGTAAGCTTGGATCCGATTAAGC
• ORF Finder: ATGAAACGTTTGACCTGAAGGTTCTACTGGAATAG
• Protein MW Calculator: MQDRVKRPMNAFIVWSRDQRRKMALEN
• DNA Translation: ATGGCTTCTGACCTGAAGGACATCGTGAACTGG

Почему такое решение

• Пользователи могут сразу увидеть, как работает инструмент
• Не нужно искать тестовые последовательности
• Улучшает UX и снижает барьер входа

Плюсы

• ✅ Улучшенный UX
• ✅ Быстрое понимание функционала
• ✅ Нет необходимости искать примеры

Минусы

• ❌ Немного больше кода на каждой странице

Подводные камни

• Важно было выбрать репрезентативные примеры
• Примеры должны демонстрировать ключевой функционал каждой страницы

Что сделано

• Добавлена кнопка "Load Example" на каждой странице
• Подобраны репрезентативные примеры для каждого инструмента

Что было

Сайт имел 6 страниц, но для увеличения органического трафика нужно было добавить больше специализированных инструментов. Навигация с 11 кнопками была перегружена.

Решение

• Добавлено 5 новых специализированных страниц:
• Codon Usage Calculator - анализ частоты использования кодонов
• FASTA Validator - валидация формата FASTA файлов
• RNA to Protein Translator - перевод RNA последовательностей в белки
• Peptide Length Calculator - расчет длины пептидов
• Amino Acid Composition Tool - анализ состава аминокислот

• Улучшена навигация:
• Основные 6 инструментов остались в главной навигации
• Дополнительные 5 инструментов вынесены в выпадающее меню "More Tools"
• Добавлена поддержка touch-устройств для мобильных

Почему такое решение

• Больше страниц = больше возможностей для ранжирования в поисковиках
• Каждая новая страница оптимизирована под свои ключевые слова
• Компактная навигация улучшает UX
• Выпадающее меню позволяет сохранить чистый интерфейс

Плюсы

• ✅ Увеличено количество страниц с 6 до 11 (+83%)
• ✅ Каждая страница имеет уникальные SEO-мета и тексты
• ✅ Компактная навигация не перегружает интерфейс
• ✅ Все инструменты остаются доступны
• ✅ Улучшенная поддержка мобильных устройств

Минусы

• ❌ Больше страниц для поддержки
• ❌ Нужно обновлять sitemap при добавлении новых страниц

Подводные камни

• Важно было сохранить единообразие дизайна на всех новых страницах
• Выпадающее меню должно работать на всех устройствах (десктоп и мобильные)
• Нужно было решить проблему с закрытием меню при перемещении курсора

Что сделано

• Создано 5 новых HTML страниц с полным функционалом
• Добавлены примеры последовательностей на каждую страницу
• Обновлена навигация в common.js с выпадающим меню
• Добавлены CSS стили для dropdown меню
• Реализована поддержка touch-устройств
• Обновлен sitemap.xml (теперь 11 страниц)
• Все новые страницы добавлены в Google Search Console verification